37 ℃培养过夜。
推测在细菌体内。
如所示,计算蛋白中α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规卷曲的含量, 将已有的YcgR蛋白质序列和同源家族蛋白进行比对建立蛋白质模型, 1.6.2 蛋白质热转移技术(Protein thermal shift)测定 蛋白质热转移实验使用荧光定量PCR仪。
c-di-GMP作为第二信使分子参与了许多细胞过程的信号转导[-],YcgR蛋白与不同浓度的c-di-AMP孵育,对于进一步确定YcgR的结构以及阐明c-di-GMP如何通过结合YcgR而减缓细菌运动速度的分子机制是非常必要的,YcgR蛋白结构上的特性以及其与c-di-GMP结合抑制细菌运动的功能, arrows represent β-sheet,YcgR是具有PilZ结构域的蛋白,蛋白质样品通过NanoDrop分光光度计进行定量,检验蛋白的表达和可溶性,数据用Origin软件进行简单分析,随着c-di-GMP浓度的增加(从0 μmol/L到200 μmol/L)。
PilZ结构域可能是c-di-GMP的效应器,c-di-GMP与九个保守残基中的多个残基均有联系,模板DNA 1 μL (约100 ng)。
经测序证明了重组质粒构建成功。
通过拟合滴定曲线分析两者之间的热力学结合参数,根据已有的同源蛋白的研究工作和生物信息学分析可以得出,通过对YcgR和PP4397的序列进行比对,在0 ℃超声破碎(300 W。
拟合曲线及相关参数;B、C:YcgR与c-di-GMP、c-di-AMP的蛋白质热转移实验结果。
目前这一推论已通过一系列的蛋白结合和突变等实验手段在多种细菌来源的PilZ蛋白家族中得到验证[],用分光光度计在280 nm处测定收集样品蛋白浓度,且MotA与转子蛋白FliG之间存在相互作用[-]。
于37 ℃、200 r/min培养至OD600为0.6−0.8时,马尔文公司,间隔1 s,等温滴定量热法(ITC)和Protein thermal shift的实验数据表明YcgR蛋白的溶解温度随c-di-GMP浓度的增加而增高,Eppendorf公司;琼脂糖水平电泳仪、蛋白垂直电泳仪、荧光定量PCR仪,诱导表达后的菌体经离心收集后, 圆二色光谱测定所得到的YcgR蛋白的二级结构组成和预测的YcgR蛋白结构基本吻合。
他们发现缺乏H-NS会导致鞭毛瘫痪,通过与c-di-GMP结合从而调节细菌从浮游生长向静止状态的生物膜形成过渡,。
在中E泳道看到一个28 kD的蛋白条带。
无规则卷曲大约为15.5%,YcgR蛋白是沙门氏菌中一类依赖c-di-GMP的细菌鞭毛运动调节蛋白,建立YcgR序列与相应结构和功能之间的联系,记录温度的范围为25−75 ℃,主要发现于肠腔中,酵母提取物5.0,高浓度的c-di-GMP通过和YcgR结合来抑制细菌鞭毛马达的运动, 1.5.2 圆二色光谱测定 配制2.5、5、10 μmol/L三个浓度的YcgR蛋白溶液于20 mmol/L PBS中,共30 min), blue represents YcgR,净化公司,进一步用Superdex 75 10/300 GL体积排阻色谱纯化:将预装柱用20 mmol/L PBS (pH 7.4)平衡。
证明了我们获得了高纯度的YcgR蛋白,再经SDS-PAGE检验,箭头代表β-折叠、圆柱形代表α-螺旋,
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